Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRCDQ00LT1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms