Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF9Q00978 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF9Q00978 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms