Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLTCQ00610 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms