Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF2BQ00403 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2BQ00403 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms