Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FAM3AP98173 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FAM3AP98173 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FAM3AP98173 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FAM3AP98173 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FAM3AP98173 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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