Protein–RNA interactions for Protein: P98153

DGCR2, Integral membrane protein DGCR2/IDD, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR2P98153 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DGCR2P98153 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DGCR2P98153 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DGCR2P98153 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DGCR2P98153 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DGCR2P98153 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DGCR2P98153 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DGCR2P98153 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DGCR2P98153 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DGCR2P98153 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DGCR2P98153 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DGCR2P98153 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DGCR2P98153 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DGCR2P98153 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms