Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKP1P63208 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms