Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms