Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P61576 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms