Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms