Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2BFSP57053 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms