Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLTPP55058 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLTPP55058 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLTPP55058 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLTPP55058 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLTPP55058 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLTPP55058 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLTPP55058 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLTPP55058 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLTPP55058 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLTPP55058 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLTPP55058 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLTPP55058 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLTPP55058 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLTPP55058 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLTPP55058 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLTPP55058 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PLTPP55058 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms