Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD4P55036 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms