Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP12AP54707 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms