Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP2S1P53680 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms