Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOSBP53539 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOSBP53539 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
FOSBP53539 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOSBP53539 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOSBP53539 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FOSBP53539 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FOSBP53539 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOSBP53539 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOSBP53539 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOSBP53539 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms