Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA2P51531 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA2P51531 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms