Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP153P49790 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP153P49790 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP153P49790 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP153P49790 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP153P49790 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP153P49790 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP153P49790 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP153P49790 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP153P49790 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP153P49790 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP153P49790 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP153P49790 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP153P49790 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP153P49790 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP153P49790 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP153P49790 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP153P49790 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP153P49790 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP153P49790 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP153P49790 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP153P49790 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP153P49790 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP153P49790 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP153P49790 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP153P49790 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP153P49790 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP153P49790 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP153P49790 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NUP153P49790 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUP153P49790 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP153P49790 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms