Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX1P48742 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX1P48742 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX1P48742 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX1P48742 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX1P48742 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX1P48742 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX1P48742 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX1P48742 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX1P48742 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX1P48742 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX1P48742 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX1P48742 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX1P48742 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX1P48742 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX1P48742 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX1P48742 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX1P48742 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX1P48742 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX1P48742 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX1P48742 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX1P48742 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX1P48742 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms