Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA2P47869 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms