Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RECQLP46063 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RECQLP46063 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RECQLP46063 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RECQLP46063 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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