Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD52P43351 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD52P43351 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD52P43351 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD52P43351 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD52P43351 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms