Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCCP43146 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCCP43146 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCCP43146 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCCP43146 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DCCP43146 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCCP43146 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCCP43146 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCCP43146 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCCP43146 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCCP43146 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCCP43146 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCCP43146 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DCCP43146 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DCCP43146 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DCCP43146 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DCCP43146 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms