Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP6P35125 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP6P35125 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP6P35125 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6P35125 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6P35125 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6P35125 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6P35125 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6P35125 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6P35125 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6P35125 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6P35125 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6P35125 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6P35125 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6P35125 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6P35125 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6P35125 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP6P35125 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms