Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 PSMC1P12-201ENST00000436509 1314 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 LINC01194-202ENST00000505877 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AL513327.1-204ENST00000630229 870 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 SNCA-202ENST00000345009 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 LINC00941-201ENST00000547804 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 MDH1-216ENST00000544381 1346 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms