Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLD1P28340 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLD1P28340 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLD1P28340 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLD1P28340 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLD1P28340 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLD1P28340 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLD1P28340 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLD1P28340 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms