Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB5P28074 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB5P28074 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms