Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2AP24928 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2AP24928 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.33■■□□□ 1
POLR2AP24928 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2AP24928 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2AP24928 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR2AP24928 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR2AP24928 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2AP24928 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2AP24928 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2AP24928 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms