Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGB6P18564 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB6P18564 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms