Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FLT1P17948 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FLT1P17948 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FLT1P17948 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FLT1P17948 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms