Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPI1P17947 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPI1P17947 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms