Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XBP1P17861 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XBP1P17861 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XBP1P17861 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
XBP1P17861 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
XBP1P17861 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
XBP1P17861 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
XBP1P17861 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms