Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2A2P16615 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms