Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EPCAMP16422 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EPCAMP16422 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms