Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms