Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL2P13500 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCL2P13500 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCL2P13500 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms