Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLBP1P12271 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms