Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI2P10070 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI2P10070 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI2P10070 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI2P10070 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI2P10070 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI2P10070 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI2P10070 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI2P10070 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GLI2P10070 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI2P10070 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI2P10070 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI2P10070 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI2P10070 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI2P10070 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI2P10070 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI2P10070 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI2P10070 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GLI2P10070 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GLI2P10070 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI2P10070 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI2P10070 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI2P10070 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI2P10070 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI2P10070 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI2P10070 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI2P10070 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI2P10070 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GLI2P10070 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GLI2P10070 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLI2P10070 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLI2P10070 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLI2P10070 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLI2P10070 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLI2P10070 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLI2P10070 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GLI2P10070 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GLI2P10070 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GLI2P10070 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GLI2P10070 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GLI2P10070 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GLI2P10070 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GLI2P10070 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GLI2P10070 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms