Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGPD2P0DJD1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms