Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms