Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ88

DUX4L5, Double homeobox protein 4-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L5P0CJ88 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX4L5P0CJ88 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms