Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CT47B1P0C2W7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms