Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLK3P07288 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLK3P07288 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLK3P07288 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms