Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
THY1P04216 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
THY1P04216 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
THY1P04216 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
THY1P04216 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
THY1P04216 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
THY1P04216 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
THY1P04216 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
THY1P04216 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
THY1P04216 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
THY1P04216 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THY1P04216 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THY1P04216 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
THY1P04216 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
THY1P04216 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
THY1P04216 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THY1P04216 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
THY1P04216 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THY1P04216 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THY1P04216 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
THY1P04216 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THY1P04216 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THY1P04216 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
THY1P04216 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THY1P04216 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THY1P04216 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THY1P04216 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THY1P04216 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THY1P04216 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THY1P04216 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms