Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EGFRP00533 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGFRP00533 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGFRP00533 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EGFRP00533 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EGFRP00533 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EGFRP00533 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EGFRP00533 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EGFRP00533 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EGFRP00533 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EGFRP00533 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGFRP00533 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGFRP00533 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGFRP00533 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGFRP00533 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGFRP00533 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGFRP00533 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGFRP00533 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGFRP00533 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGFRP00533 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EGFRP00533 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms