Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PLXNC1O60486 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNC1O60486 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms