Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIAA0556O60303 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIAA0556O60303 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms