Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP9BO43861 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms