Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms