Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYNGR3O43761 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms